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对《应用Y染色体SNP对新疆三个隔离人群遗传多样性的研究》一文的思考

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发表于 2019-10-23 12:43 | 显示全部楼层 |阅读模式
     
  1. 克里雅人、罗布人、刀郎人是生活在我国西部边疆沙漠腹地、人口稀少的隔离人群。基于对这三个隔离人群179人Y染色体全序列的测序和分型,得到每个个体Y染色体所有突变的SNP位点和隶属的单倍群,并对各单倍群类型和频率进行了分析。以探知三个隔离人群的Y染色体遗传结构和遗传多样性。通过研究结果表明:克里雅人群检出12个单倍群,高频单倍群有J2a1b1(25.64%),R1a1a1b2a(20.51%),R2a(17.95%),R1a1a1b2a2(15-38%);罗布人群检出16个单倍群,高频单倍群有J2a1(43.75%),J2a2(14.06%),R2(9.38%),L1c(7.81%);刀郎人群检出40个单倍群,高频单倍群有R1b1a1aa1(9.21%),R1a1a1b2a1a(7.89%),R1a1a1b2a2b(6.58%),C3c1(6.58%).
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        克里雅人位于于田县,塔克拉玛干大漠深处,罗布人位于尉犁县,克里木河下游,刀郎人位于克里木河中游阿瓦提县。
       罗布人的高频单蓓群显示了从伊朗出发的到印度河谷的原始农业人群的典型状态,就是J2a1,J2a2,R2,L1占优势,当然还有其他的单蓓群,说明也有过一点混合,但比例不大。克里雅人显示了初始南方农业人群(J2a1b1,R2a)和北方农业人群(R1a1a1b2a,R1a1a1b2a2)的混合。刀郎人群的混合力度就非常大了,连C3c1都出现了,已经很接近普遍意义上的维吾尔族样本了。
 楼主| 发表于 2019-10-23 13:10 | 显示全部楼层
克里雅人的J2a1b1,R2a暂时不提,R1a1a1b2a是Z94,R1a1a1b2a2是Z2124,Z94除了Z2124这个子类型外,还有Y3,Y40两个大的子类型。也就是说克里雅人的R1a都是Z94下的,这和小河墓地的结果是一致的。
刀郎人群检出40个单倍群,高频单倍群有R1b1a1aa1(9.21%),R1a1a1b2a1a(7.89%),R1a1a1b2a2b(6.58%),C3c1(6.58%)分别是M478,Y7,Z2122,Z2124,M86。M478也是现在维族的R1b类型,Y7的上游是Y9,Y9的上游是L657,L657的上游是Y2,Y3,Y7是个典型的印度次大陆类型。Z2122下游有个类型CTS6,Z2124(xZ2122)应该就是Z2125。
发表于 2019-10-23 15:57 | 显示全部楼层
wolfgang 发表于 2019-10-23 13:10
克里雅人的J2a1b1,R2a暂时不提,R1a1a1b2a是Z94,R1a1a1b2a2是Z2124,Z94除了Z2124这个子类型外,还有Y3, ...


    有原文链接吗?  测到了Z2122的下游了吗?
 楼主| 发表于 2019-10-23 16:00 | 显示全部楼层
http://www.doc88.com/p-0661743559259.html
原文在此,你可能挖掘出一些有用的消息。
 楼主| 发表于 2019-10-23 16:39 | 显示全部楼层
又发现了两例伊朗R1a样本,都来自呼罗珊省,此地受印度次大陆影响很大。一例是Y1,在L657下游,一例Y15121,在Z2123下游。
 楼主| 发表于 2019-10-23 16:55 | 显示全部楼层
哈萨克斯坦一例样本,吉尔吉斯3例样本,都在Z2125下游的YP1558,阿富汗一例样本,塔吉斯斯坦1例样本,都在Z2123下游的Y934,这倒是能和伊朗呼罗珊的样本联系起来。
 楼主| 发表于 2019-10-23 17:10 | 显示全部楼层
我现在怀疑,切尔木切克文化主要和Z94(xZ2124),尤其是L657相关,后续的安德罗诺沃文化才和Z2124相关。也就是说印度次大陆的R1a主体不是来自以前广泛认为的安德罗诺沃文化,而是更早的切尔木切克文化。安德罗诺沃文化人群主要是给印度次大陆带去了语言和文化,而不是血统。L657,Y4,Y9,Y7的年龄都在4100年左右,正好是赛伊玛-图尔宾诺文化开始扩张,切尔木切克文化人群开始四散而逃的时候。然而切尔木切克文化人群在小河的表现,Y清一色的R1a,Mt基本是C的表现,迅速扩张是很有可能的。
发表于 2019-10-23 18:25 | 显示全部楼层
wolfgang 发表于 2019-10-23 16:00
http://www.doc88.com/p-0661743559259.html
原文在此,你可能挖掘出一些有用的消息。


     粗看了一下,没有看到对R1-Z2212做更细致的分型。 不过从这几个人群的R1a类型多样性来看,估计新疆距离R1a的原发地不是很远吧
 楼主| 发表于 2019-10-23 22:23 | 显示全部楼层
新疆的R1a多样性并不高,基本都是Z94下面的。R1a的原发地,应该还是在东南高加索,后来主要迁徙到伏尔加河一带了。
 楼主| 发表于 2019-10-24 15:50 | 显示全部楼层
BMAC文化的核心区仅仅是在阿富汗北部,当然对周围文化影响很大,兴盛期只在2000-1750BC,而安德罗诺沃文化扩展到新疆是在距今3600年,也就是说,安德罗诺沃文化还没有到阿富汗北部,BMAC文化就衰败了。衰败后的BMAC文化退往伊朗高原和伊朗印度次大陆交界处,又延续了一段时间。
BMAC文化的人群,其实人数很有限,无论是面对印度河谷还是北方草原,人数都是绝对劣势。所以BMAC人群的常染在现代印度人群中不明显,大约只有5%不奇怪。能有5%就不错了,已经是明显参与的状态了。
 楼主| 发表于 2019-10-25 16:44 | 显示全部楼层
这篇文章用的snp对应的是2016 isogg y命名系统。R1a1a1b2a对应Z94,R1a1a1b2a1a对应Y7,R1a1a1b2a2对应Z2124,R1a1a1b2a2a对应Z2123,R1a1a1b2a2b对应Z2122。克里雅人占优势的R1a是Z94和Z2124,这里的Z94很可能是Y40,一个小支系,主要在印度和欧洲出现,z2124很可能也是稀有类型。刀郎人中占优势的是Z2124,Y7,Z2123,Z2122。Z2124可能是稀有类型,Y7是印度次大陆类型。克里雅人和刀郎人中都出现了Z2124的稀有类型,这可能代表了第一波进入新疆的草原人群,和小河人群有关。
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