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PRJEB34400:南德国104例新石器晚期至青铜时代中期古人基因组

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发表于 2019-10-14 10:59 | 显示全部楼层 |阅读模式
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2019-10-14 11:06 编辑

数据放出来了。

https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/PRJEB34400

Accession: PRJEB34400 ID: 577083

Kinship-based social inequality in Bronze Age Europe

Revealing and understanding the mechanisms behind social inequality in prehistoric societies is a major challenge. By combining genome wide data, isotopic evidence as well as anthropological and archaeological data, we go beyond the dominating supra-regional approaches in archaeogenetics to shed light on the complexity of social status, inheritance rules and mobility during the Bronze Age. We apply a deep micro-regional approach and analyze genome wide data of 104 human individuals deriving from farmstead-related cemeteries from the Late Neolithic to the Middle Bronze Age in southern Germany. Our results reveal that individual households lasting several generations consisted of a high-status core family and unrelated low-status individuals, a social organization accompanied by patrilocality and female exogamy, and the stability of this system over 700 years.


 楼主| 发表于 2019-10-16 10:19 | 显示全部楼层
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2019-10-16 11:41 编辑

跑了一个样本ERR3518251的类23andme文件,gedmatch上传,K7b结果如下,相对德国人,反而更接近法国人。

文献分型信息如下,分的非常粗。
AITI_43        21        Lech_EBA        M        Kleinaitingen – Gewerbegebiet Nord        3486        5.703        X2b+226        R1b1a2a1a2*


最新Isogg树分型系统结果为:R1b1a1b1a1a2b1-L2,拉丁系常见的U152+分支。https://www.yfull.com/tree/R-L2/

染色体        Hg38位置        参考序列        读取次数        读取结果        测序质量        Hg38位置        单倍体群        基因标记        标记别称        RS编号        Hg19位置        突变类型        始祖型        突变型
chrY        19995425        A        7        ,..,,,,        JJJJJJJ        19995425        P312        R1b1a1b1a1a2        PF6547|S116        rs34276300        22157311        C->A        C        A
chrY        19995425        A        7        ,..,,,,        JJJJJJJ        19995425        PF6547        R1b1a1b1a1a2        P312|S116        rs34276300        22157311        C->A        C        A
chrY        19995425        A        7        ,..,,,,        JJJJJJJ        19995425        S116        R1b1a1b1a1a2        P312|PF6547        rs34276300        22157311        C->A        C        A
chrY        5887509        T        10        .,,,.,.,,.        JJJJJ<JJJJ        5887509        L2        R1b1a1b1a1a2b1        S139        rs2566671        5755550        C->T        C        T
chrY        5887509        T        10        .,,,.,.,,.        JJJJJ<JJJJ        5887509        S139        R1b1a1b1a1a2b1        L2        rs2566671        5755550        C->T        C        T
EZ2265299_K7b.png
EZ2265299_K7b_distance.png
发表于 2019-10-16 22:53 | 显示全部楼层
这个结果和以前的一致,那个时候南德是属于凯尔特人的。
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