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Jomon genome sheds light on East Asian population history

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发表于 2019-3-17 13:35 | 显示全部楼层 |阅读模式
Abstract
Anatomical modern humans reached East Asia by >40,000 years ago (kya). However, key questions still remain elusive with regard to the route(s) and the number of wave(s) in the dispersal into East Eurasia. Ancient genomes at the edge of East Eurasia may shed light on the detail picture of peopling to East Eurasia. Here, we analyze the whole-genome sequence of a 2.5 kya individual (IK002) characterized with a typical Jomon culture that started in the Japanese archipelago >16 kya. The phylogenetic analyses support multiple waves of migration, with IK002 forming a lineage basal to the rest of the ancient/present-day East Eurasians examined, likely to represent some of the earliest-wave migrants who went north toward East Asia from Southeast Asia. Furthermore, IK002 has the extra genetic affinity with the indigenous Taiwan aborigines, which may support a coastal route of the Jomon-ancestry migration from Southeast Asia to the Japanese archipelago. This study highlight the power of ancient genomics with the isolated population to provide new insights into complex history in East Eurasia.

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/579177v1
发表于 2019-3-19 09:00 | 显示全部楼层
本帖最后由 wolfgang 于 2019-3-19 09:48 编辑
lll 发表于 2019-3-18 12:34
这篇文章好像是因为没有检测到东亚人,东南亚人具有北线马尔塔男孩所代表的古北欧亚ANE基因影响,从而否决了 ...


问题是玛尔塔男孩所代表的侠义ANE是后来才发展出来的,并不是一开始就在阿尔泰山附近的。玛尔塔男孩的常染距离中间状态的乌斯季古人比欧洲典型的
Sunghir在横轴上的距离更远,显示了和阿尔泰山地区古东亚人融合的痕迹,Yana遗址的常染就更明显了,现代美洲人遗址中的侠义ANE成分也显示了这种融合。和狭义ANE人群交流的古东亚人,其实是和东北亚ghost,黄河ghost有关系的,东亚人和东南亚的主流来源长江ghost这时候已经离开阿尔泰山区了,当然不会和狭义ANE人群有交流。我前面还从年龄上分析过,现代西欧亚主要的Y-R实际上是在那次交流中从东欧亚交流到西欧亚去的。为什么欧美人普遍不愿意接受东欧亚人群走北线呢?因为那样马上就可以发现Y-R实际上是从东欧亚交流到西欧亚的,这太难受了,比论坛里某些人接受北线起源还难受。

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发表于 2019-3-18 08:53 | 显示全部楼层
两个东南亚和平古人样本HoabMal和HoabLao,对应Reich东南亚论文中的ma911和la368,不是齿舞岛!Reich东南亚论文分析过jomon绳纹古人,给出了混合模型。

jomon_ty

jomon_ty


这篇论文太业余了!正确答案就摆在那里,却偏偏选择错误答案!文中论证jomon南线起源的证据,就是jomon与和平古人基因接近,但我们看Fig.1A,明明田园洞古人比和平古人更接近jomon,为什么不能是田园洞古人经过西伯利亚-库页岛进入日本呢?北线进入日本不但与考古学证据一致,而且完美避开了东亚核心区,因为那里已经有人了。

小贴士:和平古人、田园洞古人和绳纹古人都是类Onge人群,田园洞论文为我们揭开了四万年前Onge人群大爆发的冰山一角。Onge人群与东亚人的起源无关!
发表于 2019-3-20 22:11 | 显示全部楼层
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2019-3-20 22:14 编辑
w_howard 发表于 2019-3-20 14:50
分子钟对Y染适用,因为Y染无功能,不受环境压力影响,也不受混合重组影响。

但常染的一次混合,就可能拉 ...


速率是相对的,如果欧亚人种4万年分离不可靠,欧亚非人种在5-6万年分离也同样不可靠。但,相对值不会有大问题。

你说的混血问题是客观存在的,常染色体树不可靠也是成立的,比如介于马来人种和澳大利亚人种之间的尼格利陀onge,用其建树和用澳大利亚直接建树的结果可能是不同的。
发表于 2019-3-20 00:26 | 显示全部楼层
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2019-3-20 00:39 编辑
lll 发表于 2019-3-20 00:14
东欧亚人对ANE有基因贡献,但这种对ANE有基因贡献的更可能是像田园洞人那样的早期东欧亚人,而不是像现代 ...


不光malta,田园洞一样有着高比例的类南印度和类高加索等不见于今天东亚人的血统成分。这有两种可能,一种是此时距离欧亚人种的分离不过1.6万年左右,malta只是未分化完全的原始欧亚人种,这就像ust欧亚非啥血统都有一点,这是现代人标尺,事实上,他才是早于欧亚人分离的原始欧亚人始祖,现代人才是他的演化型。第二种可能,malta即分化不完全,也同时存在来自东欧的新移民。

换句话说,malta的年代,欧亚人种才分离1.6万年,能找到典型的蒙古人种才是匪夷所思的事情。当然,malta确实有些很强的类东欧同类文化的特征,与东方早期的石器文化差异明显,因此,又存在一波东欧移民是可能的。模式二可能性最高。


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发表于 2019-3-20 01:15 | 显示全部楼层
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2019-3-20 01:20 编辑
lll 发表于 2019-3-20 01:00
与mal‘ta差不多年代的2万年前的Afontova Gora古人也属于ANE人群,但Afontova Gora基本没有南亚常染了 ...


所以说,田园洞完全不可靠的年代,田园洞与ust只差了5000年,我无法想象五千年能变了一个人种。田园洞的角砾层,年代多在3万多年。这就好比说,你和黄帝年代的人比起来,可以差出半个高加索人种一样。事实上,就是1.5万年能差出这么多都是不太可能的。
发表于 2019-3-19 16:07 | 显示全部楼层
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2019-3-19 18:19 编辑

请注意,afontova的细石器文化基本不过外贝加尔。而外贝加尔、蒙古、东北,华北,是久克台文化,两种文化和传统非常不同,久克台文化最早出现在西伯利亚东部沿海区域,很显然一样是西伯利亚起源,而非东亚起源。
发表于 2019-3-19 10:00 | 显示全部楼层
geoanth 发表于 2019-3-19 09:51
Reich的书上明明画着从南到北穿越东亚大陆的图,你居然有脸有胆子造谣。

他要是承认东欧亚人是走北线的就得顺带承认Y-R是从东欧亚交流过来的,他哪有这个胆子?
发表于 2019-3-19 08:59 | 显示全部楼层
geoanth 发表于 2019-3-18 13:56
7,Reich的原书我手里都有。
你拿你的帖子作证据?7.

Reich的原书可以证明你的论据是不合理的,我的帖子证明实际上可以有另外一种存在。
发表于 2019-3-18 10:47 | 显示全部楼层
geoanth 发表于 2019-3-18 10:45
田园洞人地理位置靠近乌斯季人,但常染距离远。
田园洞人地理位置远离和平人、安达曼人,但常染距离近。 ...

田园洞人距离和平古人的距离还真不比田园洞人与乌斯季古人更远。
发表于 2019-3-18 10:41 | 显示全部楼层
geoanth 发表于 2019-3-18 10:37
看清楚上面的图,田园洞人、绳纹人离西伯利亚的古人(比如乌斯季)也很远。

乌斯季古人是和古东欧亚人,古西欧亚人并列的存在,当然和田园洞人,绳纹人距离很远。
发表于 2019-3-17 22:59 | 显示全部楼层
本帖最后由 lll 于 2019-3-17 23:01 编辑

这篇文章好像是支持东亚人,东北亚/东西伯利亚人和美洲原住民的祖先通过南部路线到达并从东南亚迁移到东北亚的
 楼主| 发表于 2019-3-17 23:30 | 显示全部楼层
lll 发表于 2019-3-17 22:59
这篇文章好像是支持东亚人,东北亚/东西伯利亚人和美洲原住民的祖先通过南部路线到达并从东南亚迁移到东北 ...

按照文末的几张图,齿舞群岛新石器时代古人跟小安达曼人聚在一起?是否是因为他们的常染都处于一种未向现代人群明显分化的状态?现在齿舞群岛的“原住民”是阿伊努人,与新石器时代古人常染似乎有别。
发表于 2019-3-18 00:47 | 显示全部楼层
现在国际主流都是倾向于先到东南亚再北迁的,只不过永哥他们另辟蹊径主张先北上西伯利亚再南下殖民东亚东南亚
发表于 2019-3-18 09:56 | 显示全部楼层
w_howard 发表于 2019-3-18 08:53
两个东南亚和平古人样本HoabMal和HoabLao,对应Reich东南亚论文中的ma911和la368,不是齿舞岛!Reich东南亚 ...

田园洞基因远离西伯利亚人群,靠近安达曼、和平人群。Reich的文章也说田园洞是从南北上的。你自己也说田园洞、和平和绳纹人是类Onge人群。你已经靠近正确答案,就差最后一句:田园洞和绳纹人都是由亚洲南部北上。
发表于 2019-3-18 09:59 | 显示全部楼层
日本的D系人群,从南部,经冲绳群岛,北上日本,这大概的路线应该是问题不大
但是有日本学者,按照古法仿照独木舟,从台湾,向冲绳划,包括从冲绳向日本列岛划,都失败了
按照现在的洋流,根本过不去。也许几万前的,地理位置,洋流方式,和现在差异太大。
发表于 2019-3-18 10:06 | 显示全部楼层
大凌河 发表于 2019-3-18 09:59
日本的D系人群,从南部,经冲绳群岛,北上日本,这大概的路线应该是问题不大
但是有日本学者,按照古法仿 ...

冰期末,海平面比现在低100米。D系人群北上到江苏山东,再越过很窄的东海去日本。
发表于 2019-3-18 10:17 | 显示全部楼层
geoanth 发表于 2019-3-18 10:06
冰期末,海平面比现在低100米。D系人群北上到江苏山东,再越过很窄的东海去日本。

目前没有太好的证据来支持,D1b人群到过江苏山东,并且从中国沿海向日本列岛扩散。
发表于 2019-3-18 10:24 | 显示全部楼层
大凌河 发表于 2019-3-18 10:17
目前没有太好的证据来支持,D1b人群到过江苏山东,并且从中国沿海向日本列岛扩散。

你的所谓经南部到冲绳其实也是要先到中国沿海。
发表于 2019-3-18 10:27 | 显示全部楼层
大凌河 发表于 2019-3-18 09:59
日本的D系人群,从南部,经冲绳群岛,北上日本,这大概的路线应该是问题不大
但是有日本学者,按照古法仿 ...

日本旧石器的研究很充分了,以前我看过一次觉得和原来分子人类学的推测差距比较大就没太在意,现在回过头来看可能吻合的很好。D系进入日本列岛其实不止一次,但都是从北线走的。
发表于 2019-3-18 10:31 | 显示全部楼层
wolfgang 发表于 2019-3-18 10:27
日本旧石器的研究很充分了,以前我看过一次觉得和原来分子人类学的推测差距比较大就没太在意,现在回过头 ...

绳纹人、田园洞人跟西伯利亚人群常染聚类远,排除了北线的可能。
发表于 2019-3-18 10:35 | 显示全部楼层
geoanth 发表于 2019-3-18 10:31
绳纹人、田园洞人跟西伯利亚人群常染聚类远,排除了北线的可能。

现在的西伯利亚人群都是古东亚人扩张的结果,当然和田园洞人,古绳纹人常染不类聚。
发表于 2019-3-18 10:37 | 显示全部楼层
wolfgang 发表于 2019-3-18 10:35
现在的西伯利亚人群都是古东亚人扩张的结果,当然和田园洞人,古绳纹人常染不类聚。

看清楚上面的图,田园洞人、绳纹人离西伯利亚的古人(比如乌斯季)也很远。
发表于 2019-3-18 10:45 | 显示全部楼层
本帖最后由 geoanth 于 2019-3-18 10:48 编辑
wolfgang 发表于 2019-3-18 10:41
乌斯季古人是和古东欧亚人,古西欧亚人并列的存在,当然和田园洞人,绳纹人距离很远。


田园洞人地理位置靠近乌斯季人,但常染距离远。
田园洞人地理位置远离和平人、安达曼人,但常染距离近。

这说明什么?说明田园洞人从类Onge人群中分离出来,然后北上。

绳纹人是同样情形。
发表于 2019-3-18 10:52 | 显示全部楼层
wolfgang 发表于 2019-3-18 10:47
田园洞人距离和平古人的距离还真不比田园洞人与乌斯季古人更远。

西伯利亚到华北这么平坦的地形,原本很利于基因交流,结果田园洞跟ust常染距离远,说明田园洞根本不可能是从西伯利亚由西而东到华北。只能说明田园洞是南面的类onge北上。
发表于 2019-3-18 11:58 | 显示全部楼层
geoanth 发表于 2019-3-18 10:52
西伯利亚到华北这么平坦的地形,原本很利于基因交流,结果田园洞跟ust常染距离远,说明田园洞根本不可能 ...

http://www.ranhaer.com/forum.php ... p;extra=&page=1
先看看这篇文章再说。
http://www.ranhaer.com/forum.php ... id=39306&extra=
再看看我的这篇文章。
发表于 2019-3-18 12:34 | 显示全部楼层
本帖最后由 lll 于 2019-3-18 12:35 编辑

这篇文章好像是因为没有检测到东亚人,东南亚人具有北线马尔塔男孩所代表的古北欧亚ANE基因影响,从而否决了北线的可能性,并认为东亚人走喜马拉雅山以南-东南亚路线。
这篇文章好像说明绳文人也没有ANE基因
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