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蓝海人类学在线 Ryan WEI's Forum of Anthropology

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楼主: Tocharian_2

Genome-wide data from two early Neolithic East Asian individuals

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发表于 2017-6-28 00:39 | 显示全部楼层
这个我现在还在核对,之前是根据mathieson和horvath的两篇论文认定的是R1a与Z93,但是mathi论文只有结果没有元数据索引,而horvath的论文则只说了阿凡提人群是z93,给出的索引分别是104R1a1a & Subclades – Y SNP  ...
imvivi001 发表于 2017-6-27 23:15

搞错了,是根据allentoft和horvath的两篇论文(其中allentoft又是和著名的不靠谱先生willerslev博士共同做的研究,是2015年发表在Nature上的“Population genomics of Bronze Age Eurasia”)。这次一马虎把mathi博士冤枉了,呜呜呜...
发表于 2017-6-28 00:43 | 显示全部楼层
本帖最后由 lindberg 于 2017-6-28 00:47 编辑
搞错了,是根据allentoft和horvath的两篇论文(其中allentoft又是和著名的不靠谱先生willerslev博士共同做的研究,是2015年发表在Nature上的“Population genomics of Bronze Age Eurasia”)。这次一马虎把mathi博 ...
imvivi001 发表于 2017-6-28 00:39

关于南西伯利亚的样本,铜石和青铜早期的样本太少,而且测得不全,都是引用的法国那个,两个M269,一个M73。
2015的老三篇,2016和2017都只有阿凡提的Mt数据。
发表于 2017-6-28 11:48 | 显示全部楼层
本帖最后由 imvivi001 于 2017-6-29 22:07 编辑

终于看到他的全套检测方法。是先通过17str筛选,再采用MALDI-ToF方法的芯片对设定的snp进行点射,基本上是非常正规与科学省力的方法。
这样说来,他的数据还是可信的,但是为什么mathi以及其他知名研究者没有采用他的数据呢? 难道读不懂法文还是‘文人相轻’? 不得而知,暂且存疑...

他文中给出的数据颇有助益:

Echantillons


Sexe


Hg mt


Hg Y


Cheveux

Yeux

moléculaire


Kaf


Kh19


XX


C




brun foncé - noir


brun


Kh20


XY


C


R1b1a2-M269


brun clair - brun foncé


Int.


Kh21


XY


H


R1b1a2-M269


brun clair -brun foncé


bleu


Kh22


XY


U


R1b1a-P297


brun foncé - noir


brun


Aaf


2


XX


?




-


(brun)


3


(XY)


U




-


-




Maf


TU31


XY


?


Q-M242


brun foncé - noir


brun


Ok


Kh1


XX


C




-


brun


Kh2


XX


C




brun foncé - noir


brun


Kh3


XX


H




-


(brun)


Kh7


XY


J


R1b1a2-M269


-


bleu


Kh8


XY


H


Q1a3-M346


brun foncé - noir


brun


Kh9


XX


A




-


-


Kh12


XY


U


NO ( non O)


brun foncé - noir


brun


Kh13


XY


H


NO ( non O)


brun clair - brun foncé


brun


Kh14


XX


T




brun foncé - noir


brun


Kh15


X(Y)


D


NO ( non O)


-


brun


Kh16


XX


C




-


-


Kh17


X(Y)


A


Q1a3a-L54


-


(brun)


Kh18


(XY)


A




-


-


Sag


TA4


XY


T


R1a1a1b2-Z93


brun foncé - noir


brun


TA8


XY


U


Q1a3a-L54


-


int.


TA9


XX

D5a2



brun foncé - noir


brun


TA10


XY

C4a1

R1a1a1b2-Z93


brun clair - brun foncé


brun


TA11


XY


D


Q1a3a-L54


brun foncé - noir


brun


TA12


XY


?


Q1a3a-L54


brun foncé - noir


brun


TA14


XY


D


R1a1a1b2-Z93


brun clair - brun foncé


bleu


TU15


XX


H




brun clair - brun foncé


brun


TU17


XY


A


C-M130


brun clair - brun foncé


brun


TU18


(XX)


D




-




TU34


XY


H


R1a1a1b2-Z93


brun clair - brun foncé


brun


El


6


XY


C


Q1a3-M346


-


brun


7


XY


C


(Q_M242)


-


(brun)


8


XX


D




-








9


XY


C


?


-


brun


MK


AT_614


XY


H


NO ( non O)


brun foncé - noir


brun


AT_861


XY


D


NO ( non O)


-


-


ChemN


AT_626


XY


D


C-M130


-


brun


AT_635


XX


A




-


(brun)



   表中的Kaf、Aaf与Maf均是指阿凡纳谢沃文化;Ok是指奥库涅夫文化;El是指阿尔泰地区的Elunin文化;Sag是指Sagsai大型古墓(作者称之为一种文化,但是欧美主流学者态度暧昧,有一点类似他们对东方色彩浓烈的奥库涅夫文化一样,why?);ChemN是指位于科布多的切木尔切克文化古墓,年代为2500-2300BC;MK是指蒙古西部Mönkhkhairkha山古墓,年代为1700-1400BC(殷商时期);


     看得出来,即便是最早期的阿凡纳谢沃人群也不是铁板一块,东部西伯利亚土著y-Q人群也参与其中。之后y-N与y-C人群更是积极参与进来了。而且,大部分都是深棕与黑头发,浅棕色头发基因变异很少,这个倒是与颜那亚人群基本一样。
   总的来说,这份内容丰富的数据对欧洲中心主义者来说是很不讨喜的,基本彻底粉碎了青铜时期南俄骑兵草原无敌的神话。另外,最早的大规模骑马游牧民族未必起源于南俄草原,更有可能起源于哈萨克斯坦一带。
发表于 2017-6-29 23:05 | 显示全部楼层
39# imvivi001
2015的老三篇,2016年拉博士的和2017马博士的表格里都有(记错了,都是Mt),不过我觉得不重要,很可能和东欧草原一样,R1a说不定是下层人民
lindberg 发表于 2017-6-27 23:17


根据Clemence对阿凡纳谢沃人群的检测,他们的mt包括2个C,两个U和1个H。 但是根据Mathieson的结果,分别是T2c1a2、J2a2a、J2a2a、U5a1a1以及U5a1a1。两组数据明显不同,可能是根据不同的遗骨来源,而Clemence的遗骨是来自俄国专门研究早期阿尔泰人群的A Kovalev教授。
发表于 2017-6-30 12:22 | 显示全部楼层
这个我现在还在核对,之前是根据mathieson和horvath的两篇论文认定的是R1a与Z93,但是mathi论文只有结果没有元数据索引,而horvath的论文则只说了阿凡提人群是z93,给出的索引分别是104R1a1a & Subclades – Y SNP  ...
imvivi001 发表于 2017-6-27 23:15

阿凡纳谢沃文化人群是R1b,这是我看了2015老三篇后的结论。你可以回头去看这三篇。某篇中有一个图直接显示颜那亚全是R1b,另一图显示颜那亚与阿凡纳谢沃基因成分一致,文中还说这二者DNA几乎无法区分。
发表于 2017-6-30 13:09 | 显示全部楼层
46# geoanth
不明白你要表达或反驳什么...?
发表于 2017-6-30 13:15 | 显示全部楼层
阿凡纳谢沃文化人群是R1b,这是我看了2015老三篇后的结论。你可以回头去看这三篇。某篇中有一个图直接显示颜那亚全是R1b,另一图显示颜那亚与阿凡纳谢沃基因成分一致,文中还说这二者DNA几乎无法区分。
geoanth 发表于 2017-6-30 12:22

回头去看了一下论文,我的记忆基本没错。Allentoft 2015文中有这样的句子:“The Early Bronze Age Afanasievo culture in the Altai-Sayan region is genetically indistinguishable from Yamnaya, confirming an eastward expansion across the steppe.” 也就是说Yamnaya人群和Afanasievo的DNA相同。此文Extended Data 图6显示Yamnaya人群80%是R1b,剩下是I(此图中有一个AfGo,注意这是铁器时代的Afontova Gora文化,不要与
Afanasievo 文化混淆)。正文图3左下小图也显示二者DNA几乎无法区分。所以结论就是Afanasievo人群80%是R1b,剩下是I。
发表于 2017-6-30 13:19 | 显示全部楼层
46# geoanth
不明白你要表达或反驳什么...?
imvivi001 发表于 2017-6-30 13:09

反驳Afanasievo人是R1a-z93。
发表于 2017-6-30 14:43 | 显示全部楼层
反驳Afanasievo人是R1a-z93。
geoanth 发表于 2017-6-30 13:19

请问你认识中文和阿拉伯数字吗? 或者你的浏览器有问题,没看到上面我贴出的表格吗?
发表于 2017-6-30 15:03 | 显示全部楼层
本帖最后由 geoanth 于 2017-6-30 15:10 编辑
请问你认识中文和阿拉伯数字吗? 或者你的浏览器有问题,没看到上面我贴出的表格吗?
imvivi001 发表于 2017-6-30 14:43

下面这是你说过的话吗?
除此之外,对Afanasevo阿凡纳谢沃文化人群的检测也发现这个人群存在高频的370a,而阿凡纳谢沃文化人群几乎是清一色的R-Z93。

如果你认为你的话没错,请再看看我前面的帖子。
如果你承认你这段话错了,何来这么大怒气?
发表于 2017-6-30 16:18 | 显示全部楼层
51# geoanth
我小学五年级还说过元谋猿人是现代中国人的直系祖先呢,那要不要也需要和你解释一下
发表于 2017-6-30 16:22 | 显示全部楼层
51# geoanth
我小学五年级还说过元谋猿人是现代中国人的直系祖先呢,那要不要也需要和你解释一下
imvivi001 发表于 2017-6-30 16:18

如果你认为你下面这段话是小学五年级水平,我没意见。


除此之外,对Afanasevo阿凡纳谢沃文化人群的检测也发现这个人群存在高频的370a,而阿凡纳谢沃文化人群几乎是清一色的R-Z93。
发表于 2017-6-30 17:08 | 显示全部楼层
53# geoanth
请看清楚我上面的原话:
---------------------------------------

终于看到他的全套检测方法。是先通过17str筛选,再采用MALDI-ToF方法的芯片对设定的snp进行点射,基本上是非常正规与科学省力的方法。
这样说来,他的数据还是可信的,但是为什么mathi以及其他知名研究者没有采用他的数据呢? 难道读不懂法文还是‘文人相轻’? 不得而知,暂且存疑...

他文中给出的数据颇有助益:
Echantillons
Sexe

Hg mt

Hg Y
Cheveux
Yeux
moléculaire

Kaf


Kh19
XX
C

brun foncé - noir
brun

Kh20
XY
C
R1b1a2-M269
brun clair - brun foncé
Int.
Kh21
XY
H
R1b1a2-M269
brun clair -brun foncé

bleu

Kh22
XY
U
R1b1a-P297
brun foncé - noir
brun

Aaf

2
XX
?


(brun)
3
(XY)

U

-
-

Maf
TU31
XY
?
Q-M242
brun foncé - noir
brun
...  ...  ...  ...   .....   ......  ....


   表中的Kaf、Aaf与Maf均是指阿凡纳谢沃文化;Ok是指奥库涅夫文化;El是指阿尔泰地区的Elunin文化;Sag是指Sagsai大型古墓(作者称之为一种文化,但是欧美主流学者态度暧昧,有一点类似他们对东方色彩浓烈的奥库涅夫文化一样,why?);ChemN是指位于科布多的切木尔切克文化古墓,年代为2500-2300BC;MK是指蒙古西部Mönkhkhairkha山古墓,年代为1700-1400BC(殷商时期);


     看得出来,即便是最早期的阿凡纳谢沃人群也不是铁板一块,东部西伯利亚土著y-Q人群也参与其中。之后y-N与y-C人群更是积极参与进来了。而且,大部分都是深棕与黑头发,浅棕色头发基因变异很少,这个倒是与颜那亚人群基本一样。
------------------------------------------------------------------------


    另外,在你配好一副质量过关的老花镜和温习好初二中文语文之前,请你不要来打扰我!
发表于 2017-6-30 19:10 | 显示全部楼层

另外,在你配好一副质量过关的老花镜和温习好初二中文语文之前,请你不要来打扰我!
imvivi001 发表于 2017-6-30 17:08

imvivi001

搞错了,是根据allentoft和horvath的两篇论文(其中allentoft又是和著名的不靠谱先生willerslev博士共同做的研究,是2015年发表在Nature上的“Population genomics of Bronze Age Eurasia”)。这次一马虎把mathi博士冤枉了,呜呜呜...



你说阿凡纳谢沃文化是清一色的R1a-Z93后,后来看到一篇法语文章证明你的说法不靠谱后,你不肯老老实实承认自己的错误,反而把责任推给Allentoft。我前面的帖子已经说明,从Allentoft的文章就可以知道阿凡纳谢沃人主要是R1b。


你真可悲。
发表于 2017-6-30 20:08 | 显示全部楼层
搞错了,是根据allentoft和horvath的两篇论文(其中allentoft又是和著名的不靠谱先生willerslev博士共同做的研究,是2015年发表在Nature上的“Population genomics of Bronze Age Eurasia”)。这次一马虎把math博士冤枉了,呜呜呜......
imvivi001 发表于 2017-6-28 00:39


果然不愧是和著名的不靠谱博士合作的成果,这次的不靠谱简直达到令人发指的地步,请看:
allen-青铜-Y--欧亚大草原--2015.png

通篇在讨论青铜时期的欧亚草原人群DNA,却只是笼统地在结尾搞一个索引表,具体引用人家的哪一个数据只字未提。 这个且不说。更令人晕倒的是,把 Afanasievo标记成Afontova Gora,把R1b标记成R1a。真不知道当时Nature的小编是如何审稿的?? 难道长一副白人面孔就可以降低收稿门槛吗??
   
    看来还是应了那句老话,二流学者和二流学者加在一起还是成为不了一流学者,呜呜呜...
发表于 2017-6-30 20:19 | 显示全部楼层
本帖最后由 geoanth 于 2017-6-30 20:46 编辑
通篇在讨论青铜时期的欧亚草原人群DNA,。。。。更令人晕倒的是,把 Afanasievo标记成Afontova Gora,
imvivi001 发表于 2017-6-30 20:08


Allentoft的文章里就是讨论了Afontova Gora。你偏要把那图上的Afontova Gora脑补成Afanasievo,然后倒打一耙。
Allentoft的文章里同时还讨论了铁器时代,你贴的图上irAltai就是铁器时代阿尔泰。你理解水平烂,但是倒打一耙倒是很熟练。
看看下图,Allentoft的文章里讨论了多少文化。是不是同时讨论了Afontova Gora和Afanasievo?
afan.png
发表于 2017-6-30 20:44 | 显示全部楼层
看看Allentoft文章中的图3,作者是不是显示了Afanasievo和Yamnaya人的DNA几乎相同,而与Afontova Gora有显著区别?
imvivi001理解有问题,却倒打一耙。但这能改变事实吗?
afan2.png
发表于 2017-6-30 21:07 | 显示全部楼层
58# geoanth

我们之间不具备对话的基础,已经交给管理员处理了,别的不想浪费时间~~
发表于 2017-6-30 21:12 | 显示全部楼层
58# geoanth

我们之间不具备对话的基础,已经交给管理员处理了,别的不想浪费时间~~
imvivi001 发表于 2017-6-30 21:07

很好,你终于不再挣扎了。
发表于 2017-7-1 18:50 | 显示全部楼层
本帖最后由 lindberg 于 2017-7-2 00:43 编辑

44# imvivi001
sag这个是有争议的,有人认为是卡拉苏克II期文化,有人认为是一种平行文化(时间比卡拉苏克I期晚)。

sag的核心区在阿尔泰东北坡,而卡拉苏克核心区在南西伯利亚地区(环萨彦-阿尔泰)的西北部,可能在sag期的时候,卡拉苏克I期已经被其他文化覆盖了。

发现最近论坛流行挖坟,很多老帖子都被挖出来了。
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