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3,249个日本样本的Y-STR数据

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发表于 2013-7-7 21:09 | 显示全部楼层 |阅读模式
如附件所示。其中 Yfiler 17STR 为2116例。


数据来自:

nref 
252Jap1Haplotype analysis of  17 Y-STR loci in a Japanese population
381Jap212 Y-chromosomal STR  haplotypes in Japanese
1166Jap3Population genetics  of 17 Y-chromosomal STR loci in Japanese
950Jap416 Y chromosomal STR  haplotypes in Japanese
237ref 5Hammer2005 Dual  origins of the Japanese-common ground for hunter-gatherer
and farmer Y  chromosomes
263ref 6Y-chromosomal Binary  Haplogroups in the Japanese Population and their
Relationship to 16 Y-STR  Polymorphisms

Y-STR of Japanese.rar

274.09 KB, 下载次数: 103

评分

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 楼主| 发表于 2013-7-7 21:12 | 显示全部楼层
其中包括 Hammer2005 日本人双起源这篇文章的STR数据。这篇文献是比较早的,测试得最精细的文献之一。 这份数据,也是用来推测其他日本Y-STR样本的Y-SNP的重要参考。 ref6的Y-SNP,我一直没有仔细看原文是不是真测了。

整理这个数据主要是为了看看因 HG C-M216的系统树更新后 C1-M8的STR数值问题。结果看到,冲绳县的C1比例(~10%)看看高于其他地区。

此外, C3的多样性也比较高。看来日本的C3还是很复杂的。特别还有 DYS392=10的 C3c-M86.

有9例 Q1a1-M120。

我只做了很粗浅的Y-SNP推测,也没有全部做。除了C1外,仅供参考。这里的大部分网友的推测水平都比我高了。 日本人的Y-STR其实很很值得研究的。除了本土的D2,C1外,其他类型很大程度能够反映亚洲大陆的移民,特别是O3下的各个支系。对于大陆东部沿海一代的远古移民事件,某种程度上有不可替代的作用。


我之前考虑了一套 用Y-STR推测Y-SNP HG的算法,经此次检验,仍不能区分SNP很近的单倍群,需要再考虑算法问题。期望是作出一个 可以批量且准确的推测算法。
发表于 2013-7-7 21:27 | 显示全部楼层
我去,这个汇总,强悍啊。
发表于 2013-7-7 21:56 | 显示全部楼层
...整理这个数据主要是为了看看因 HG C-M216的系统树更新后 C1-M8的STR数值问题。结果看到,冲绳县的C1比例(~10%)看看高于其他地区。
Ryan 发表于 2013-7-7 21:12


05年的str检测数据我看还是要谨慎一点,当然,如果考虑到部分C人群的极度抗寒能力,不排除远古有一批C1人群北上跟随猎鹿人采取‘快速迁移模式’迁移去了东北欧继而进入欧洲定居。
还有一个不太靠谱的推测,就是远古时期某‘先进文明的C1人群’发明了飞机,后来不太幸运的是,他们的科技精英全部飞机遇难,这就是欧洲‘阿特兰提斯’传说的由来~
发表于 2013-7-8 00:07 | 显示全部楼层
5# sahaliyan
这说明C1和V20分开很早,末次冰盛期都是最迟的可能。
发表于 2013-7-27 23:34 | 显示全部楼层
我国东北的民族有高频的C1,C1也可能是移民弥生人带去的吧?
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