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HLA-A*24 基因频度

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发表于 2013-3-5 16:38 | 显示全部楼层 |阅读模式
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2013-3-5 18:03 编辑

HLA-A*24 好像在蒙古族中比例较低20.8%。HLA-ABDRB1

数据库中,03样本主要是欧美人,04没有样本,分布不详,05是几例USA Hispanic。06分布不详,07型在美国亚洲人,台湾,菲律宾等地有一定比例。08型见于美国亚洲人。09N分布不详。另外,还有一堆,没仔细查。
人群大多数样本均为HLA-A*24 02 非洲很罕见。

A*2402 has one of the highest "A" frequencies identified for a number of peoples, including Papua New Guineans,Indigenous Taiwanese (Eastern Tribals), Yupik and Greenland Eskimos. It is common over much of Southeastern Asia. In Eurasia it is least common in Ireland, and A24 is relatively uncommon in Africa except North Africa and Kenya.

HLA A*24 02 frequencies
Taiwan  Paiwan86.3
Taiwan  Tsou78.4
Taiwan  Rukai76
Papua New Guinea Goroka74.4
PNG  Karimui Plateau74.4
Taiwan  Puyuma64
Taiwan Ami62.8
PNG  Wanigela62.7
Taiwan  Atayal61.8
Ecuador  Cayapa61.4
New  Caledonia60.7
Venezuela  Perja Mtn. Bari60.2
USA Alaska  Yupik Natives58.1
Taiwan Tao54
PNG Wosera51.3
Taiwan  Siraya47.1
Taiwan  Taroko44.5
Mexico  Chihuahua Tarahuma…37.5
USA  Arizona Pima36
Taiwan  Pazeh33.6
Japan  Okinawa Ryukuan33.5
American  Samoa33
Japan (5)32.7
Philippines  Ivatan32
PNG New  Britain Rabaul31.6
N. Mexico  Canoncito Navaj…30.5
Australia  Indig. Yuendumu29.8
Australia  Indig. Groote E…29.3
China  Tibetans27.2
S. Dakota  Lakota Sioux26.2
Mexico  Mixtec Oaxaca24.5
Japan Ainu  Hokkaido24
Venezuela  Perija Mtns. Yu…23.3
Mexico  Zaptotec Oaxaca23.1
USA North  American Native…22.7
Australia  Indig. Cape Yor…22.3
Ch.  Guangdong Meizhou Han22.2
Russia  Tuva (2)21.5
Singapore  Chinese Han21.5
India  North Hindus20.2
Mongolia  Buriat20
China  Inner Mongolia19.6
USA Asian18.9
Taiwan  Minnan (1)18.6
China  South Han17.2
Georgia  Tibilisi Georgian…17.1
India  Mumbai Marathas16.7
Mexico  Guadalajara Mestiz…16.5
Singapore  Riau Malay16.5
Croatia16
India  Khandesh Pawra16
Singapore  Javanese Indone…16
South  Africa Natal Tamil16
India  Tamil Nadu Nadar15.6
PNG Madang15.3
China  North Han15.2
USA South  Texas Hispanics15.2
PNG West  Schrader Ranges14.2
China  Guangxi Maonan13.4
Mexico  Mestizos13.4
Georgia  Svaneti Svans13.1
Romanian12.7
Pakistan  Burusho12.5
USA  Hispanic12.2
Bulgaria11.8
Georgia  Tibilisi Kurds11.7
India New  Delhi11.4
Pakistan  Sindhi10.7
USA  Caucasian10.7
France  South East10.6
Pakistan  Pathan10.2
Cameroon  Pygmy Baka10
Finland9.4
Brazil8.6
Australia  Indig. Kimberly8.3
Australia  New South Wales8.2
Israel  Arab Druse8
Pakistan  Baloch8
Portugal  Centre8
Cameroon  Sawa7.7
Brazil  Terena7.5
Ireland  South6.8
Tunisia6.7
Belgium6.6
Morocco  Berber Nador Meta…6.2
Jordan  Amman5.9
Oman5.9
Mexico  Mixe Oaxaca5.7
Portugal  North5.4
Sudanese5.3
Mexico  Sonora Seri4.5
Uganda  Kampala4.3
Thailand3.9
Iran  Baloch3.4
USA  African America2.8
Kenya2.1
Guinea  Bissau1.5
Czech  Republic1
Kenya  Nandi1
mongolian.jpg
 楼主| 发表于 2013-3-5 16:47 | 显示全部楼层
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2013-3-5 17:40 编辑

世界人群中的分布,http://www.allelefrequencies.net/
 楼主| 发表于 2013-3-5 17:01 | 显示全部楼层
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2013-3-5 17:03 编辑

河南郑州汉族HLA-A*24+个体似乎对子痫前期发病有阻抗作用。

正常晚孕组配偶:18.63%
正常晚孕组:15.69%

子痫前期组配偶:5.66
子痫前期组孕妇:10.38%

2父源性HLA-A24基因可能是子痫前期发病的抗性因子。

3夫妇均携带HLA-A11基因或均不携带HLA-A24基因时,子痫前期的易感性增加。

父源性HLA-A基因与子痫前期相关性研究
 楼主| 发表于 2013-3-5 17:09 | 显示全部楼层
HLA-A*24华南汉族(可能是广东人)的分布。


中国华南地区慢性乙型肝炎(CHB):21%健康对比组:24%



中国华南地区慢性乙型肝炎患者HLA—A等位基因分布的初步调查及其意义
 楼主| 发表于 2013-3-5 17:17 | 显示全部楼层
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2013-3-5 17:19 编辑

西北地区汉族 17%

西北地区汉族人群HLAA、B、DRB1基因座单倍型分析
兰州汉族 17.25%

西北地区汉族人群HLAA、B、DRB1基因座单倍型分析
xibei han.jpg
lanzhou han.jpg
 楼主| 发表于 2013-3-5 17:26 | 显示全部楼层
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2013-3-5 18:01 编辑

HLA多态性在广东汉族人群分布的特殊性
对比组数据似乎有问题,先mark
guangdong.jpg
 楼主| 发表于 2013-3-5 18:11 | 显示全部楼层
Dravidian的比例也巨高。

HLA-A allele frequency and haplotype distribution in the Dravidian tribal communities of South India
Dravidian hla.jpg
 楼主| 发表于 2013-3-5 18:20 | 显示全部楼层
江苏汉族

1型糖尿病患者自身抗体与HLA-A等位基因的关系

正常组:16.36%。



江苏南京HLA 24.jpg
 楼主| 发表于 2013-3-5 18:31 | 显示全部楼层


广东汉族:结果显示:CML(慢性髓系白血病)组HLA—A*24基因频率为15.53%,显著低于对照组22.09%(RR=0.63,P=0.005)。


广东地区CML患者中HLA-A,B,DRB1的表达与分析

 楼主| 发表于 2013-3-5 18:39 | 显示全部楼层
湖北土家族15.73%。

Distribution of HLA-A, -B and -DRB1 Genes and Haplotypes in the Tujia Population Living in the Wufeng Region of Hubei Province, China



土家族 HLA.png
 楼主| 发表于 2013-3-5 18:50 | 显示全部楼层
陕西籍汉族造血干细胞献血者HLA-A、-B、-DRB1高分辨多态性分析

HLA-A* 24( 14.86%),以2402最常见.



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