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春秋時秦墓殉葬古mtDNA

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发表于 2011-6-12 18:53 | 显示全部楼层 |阅读模式
几例MTDNA数据

j.1475-4754.2010.00553.x.pdf

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发表于 2011-6-12 20:25 | 显示全部楼层
這篇文章非常好,有數據,有方法,但作者缺乏人類學知識的基礎,我覺得正好適合各位人類學愛好者練練手,自己預測一下單倍型。
发表于 2011-6-12 21:05 | 显示全部楼层
可怜的姑娘为我们留下宝贵的数据。
发表于 2012-2-13 09:26 | 显示全部楼层
文章全名叫什么?顶楼附件下不了了
发表于 2012-2-13 10:16 | 显示全部楼层
《SEX IDENTIFICATION OF SLAVE SACRIFICE VICTIMS FROM QIN STATE TOMBS IN THE SPRING AND AUTUMN PERIOD OF CHINA USING ANCIENT DNA》

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发表于 2012-2-13 10:48 | 显示全部楼层
提示附件不存在?
发表于 2012-2-13 10:59 | 显示全部楼层
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abbr_3919a3b72aa612bce185dcda40cc5a5b.pdf

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发表于 2012-2-13 12:52 | 显示全部楼层
本帖最后由 198401 于 2012-2-13 12:53 编辑

殉葬人骨应该来自陕西凤翔(秦都雍城)秦公一号大墓。
作者仅仅是为了获得殉人的性别。
高变1区

QQ截图20120213124337.png
CRS是剑桥标准序列
发表于 2012-2-13 20:14 | 显示全部楼层
测试似乎太粗,只判断到F, M,  意义不大。
发表于 2012-2-13 20:33 | 显示全部楼层
9# 历史的天空

那个是性别
发表于 2012-2-13 22:58 | 显示全部楼层
本帖最后由 历史的天空 于 2012-2-13 23:21 编辑

10# 198401

晕,只看 Column Title: aDNA molecular identification, 没有看Table Title.
一篇文章只是为了判别性别,有啥意义嘛
不过根据上面的表是可以预测? 我预测一个M5号是F3?
发表于 2012-2-14 08:55 | 显示全部楼层
判别性别,根据人骨基本就可以了,  何必还要测DNA?  测了DNA又不判定?  搞不懂
发表于 2012-2-14 13:01 | 显示全部楼层
晕,人家测序不是为了判别性别,而是说,男1号的序列是什么,女10号是什么。
更何况测mt判不了性别。
发表于 2012-2-15 07:47 | 显示全部楼层
T1, A1, M42是A4。比例很大:-)。
发表于 2012-3-3 19:52 | 显示全部楼层
秦组与体制上接近远东类型的特征还是相符的。粗略匹配结果。

61T1Qin stateA 209 223
290 311
319 362
61T2Qin stateD 223
61T3Qin stateC 223 298
303 327
61A1Qin stateAA4223 290
319 362
61A2Qin stateM7 173 223
295 362
61M5Qin stateZ 185 223
260 298
61M42Qin stateDD4223 290
362
61M45Qin stateD 223 290
61M90Qin stateD 185 223
298 362
发表于 2012-3-3 19:59 | 显示全部楼层
T组是技术人员,A组是考古学家。M组是古秦人。
发表于 2013-8-14 08:56 | 显示全部楼层
周人少陵原样本一个D没有,而此组秦人样本3例均为D。。。
发表于 2013-8-14 19:05 | 显示全部楼层
本帖最后由 baiyueren 于 2013-8-14 19:17 编辑
周人少陵原样本一个D没有,而此组秦人样本3例均为D。。。
Yungsiyebu 发表于 2013-8-14 08:56

小永,不是我说你,你的mt分型水平是很差的。
那些带223 290的样本更有可能是A。这组古DNA数据跟少陵原差不多,降解得比较厉害。

T1A4209 223 290 311 319 362
T2?223
T3C223 298 303 327
A1A4223 290 319 362
A2M*173 223 295 362
M5Z185 223 260 298
M42A4223 290 362
M45A?223 290
M90Z185 223 298 362
发表于 2013-8-14 22:47 | 显示全部楼层
小永,不是我说你,你的mt分型水平是很差的。
那些带223 290的样本更有可能是A。这组古DNA数据跟少陵原差不多,降解得比较厉害。

T1A4209 223 290 311 319 362T2?223T3C223 298 303 327A1A4223 290 319 362A2M ...
baiyueren 发表于 2013-8-14 19:05

呵呵,自以为是。。。你的判断完全不合乎逻辑,尽管我不能绝对排除可能性。

223 290 362 这个突变,的确不排除是A,也不排除是M12,但绝对是一个高频出现在D的突变组合,95%以上判断为D是毫无问题的。


223 290不可能是A,在我汇总的数据没有任何一例相同突变的样本属于A,可能性低于5%。


185 223 298 362缺少Z的基本突变,尽管不排除回复突变的可能,但可能性极低。


发表于 2013-8-15 09:40 | 显示全部楼层
20# Yungsiyebu
你没看懂我的意思吗?古DNA的特点就是部分碱基已经降解,所以对应的一些位点测不出。而且论文通常会显示检测的是哪些常见位点,那么那些不常见的位点就遗漏了,但并不是说没检测的位点上就完全没有突变存在。
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