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复旦UROP计划论文:《利用Y染色体新增遗传标记解析汉族常见单倍型002611的源流》

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发表于 2011-5-4 10:45 | 显示全部楼层 |阅读模式
复旦丁琦亮的一篇待出炉文章:

《利用Y染色体新增遗传标记解析汉族常见单倍型002611的源流》

1.1 课题目的

分子人类学的诞生和发展,为解决人类起源、进化、迁徙等诸多科学问题提供了新的证据和极有价值的信息。人类Y 染色体,由于其父系遗传、缺乏重组等成为分子人类学研究父系遗传结构的理想材料。近年来,随着大规模测序技术的成熟及成本的持续降低,Y染色体上游越来越多的遗传标记被发现。本课题即采用Y染色体全测技术所获得的Y染色体新增遗传标记IMS-JST002611及其下游十余个位点对东亚不同地区、不同族群的样本进行精细分型,并结合已经相当成熟的STR分子钟,推断出单倍型002611的起源、演化及扩张的全过程。

......

在2011年发表的研究成果中,Yan et. al[13]指出,可能有超过21%的东亚人及大约16.9%的中国人携带了002611这一遗传标记。如图2所示,相对于其他与其平行的遗传标记定义的单倍型(如O3a1-M121、O3a2-M164等),O3a1c-002611在属于O单倍型的中国人中的比例是最高的,但却一直没有对该单倍群进行研究的论文发表。另据我们实验室的进一步研究,找到了F646、F337等16个002611的下游位点,而这些新位点的大规模检测工作尚未在中国人群中进行。

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 楼主| 发表于 2011-5-4 11:12 | 显示全部楼层
本帖最后由 雄镇散人 于 2011-5-4 11:18 编辑

标题及正文中有个小问题,建议更正:O3a1c是一个单倍(haplogroup),不是一个单倍(haplotype)。至于IMS-JST002611,它是个SNP,就更连“单倍型”都谈不上了,标题中何谈“单倍型002611的源流”?这是有问题的。

我觉得复旦学生写的文章就“干货”而言都肯定是值得一读的,不过要发表到国际或国内权威刊物上的话,作为代表中国分子人类学形象的复旦论文里,像这样的naming convention问题还是避免为好。包括论文里的一些基本英文语法错误,比如把the same trend as写成了the same trend with(典型的中国式英语。英文里the same后面跟个with的情况是有,但不是这层意思),像这种类型的英文基本语法类硬伤应该彻底消失。加强复审。
发表于 2011-5-4 11:17 | 显示全部楼层
本帖最后由 反恐 于 2011-5-4 11:45 编辑

对东亚不同地区、不同族群的样本进行精细分型,并结合已经相当成熟的STR分子钟,推断出单倍型002611的起源、演化及扩张的全过程。
+++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++

如果起源、扩散的时间可以比较精确地估算出来,在缺乏古DNA的情况下,对于推测古代某些文化人群对应的单倍群是极有价值的。
发表于 2011-5-4 12:11 | 显示全部楼层
该文的意义毋庸讳言,期待该文的正式面世。
发表于 2011-5-4 14:37 | 显示全部楼层
山东省博物馆一堆人骨,复旦给老永发个证书,咱出差顺便游说一圈,比硬猜强,哈哈。
 楼主| 发表于 2011-5-4 15:37 | 显示全部楼层
山东省博物馆一堆人骨,复旦给老永发个证书,咱出差顺便游说一圈,比硬猜强,哈哈。
Yungsiyebu 发表于 2011-5-4 14:37


这年头,“硬猜”论很吃香啊。打不赢就直接趴地上,曰:你在硬猜!
 楼主| 发表于 2011-5-4 23:49 | 显示全部楼层
只说一句:M117也是一样。

但愿尽早结束大锅饭的日子。就算是*也是好的。

期待薛雅丽团队的进展。
发表于 2011-5-5 22:53 | 显示全部楼层
感谢指教!
另外有个小问题:haplogruop和haplotype到底有什么区别?
再次感谢!
andyding13 发表于 2011-5-5 17:59

給大家引見一下,andyding13是我和王傳超的小弟,入行不久,請大家多包涵、指教。

單倍型是(已測定位點的或者選出用於比較的)特定的組合,比如相同的一套STR結果,或者一些完全相同的HVS I序列構成一個單倍型。單倍群是一些具有共同特徵的樣本的組合,比如O3、R等等。所以002611是突變位點,不是單倍群,也不是單倍型。STR的比如17-12-16-23-10-14-13算單倍型,而O3a1a-002611這算單倍群。
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