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对dienekes世界人群主成分分析的截取和分析

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发表于 2010-12-20 16:42 | 显示全部楼层 |阅读模式
dienekes这组世界人群主成分分析图还是有很多新东西的,因为涉及到的人群多。所以比较有价值。但是因此图片容量也超标。反正我们只对大东亚感兴趣,所以下面我就把图片剪接开来,慢慢分析。
下面两幅图是K=15时大东亚人群的情况:
旋转 ADMIXTURE_15-1.png

旋转 ADMIXTURE_15-2.png

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发表于 2010-12-20 16:51 | 显示全部楼层
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2010-12-20 16:54 编辑

彝族、土族都有些南亚的紫色成分;维吾尔和柬埔寨的比例不低,其他人群极微弱。
日本、印度(新加坡)、马来(新加坡)、柬埔寨可见一些与美拉尼西亚共享的浅黄色成分,其他人群极微弱。
 楼主| 发表于 2010-12-20 16:53 | 显示全部楼层
灰色成分在日本人中最高,在东亚,东南亚,北亚族群中普遍存在。可以认为这对应着远东人种的成分,橘黄色在东亚和南亚族群中衣普遍存在,在柬埔寨和新加坡马来人中比例最高,可以认为对应着南亚人种的成分。紫色是印度南部人种中最高,可以对应为印度成分,深蓝色和黄辉色在北极人种中占优势,可以认为是北极人种的成分而浅灰色,则在nganassan人中最高,在yakut人中次高,这实际上是北极--乌拉尔成分的西部成分。
发表于 2010-12-20 17:05 | 显示全部楼层
日本的橘黄色成分极其微弱,还不如与美拉尼西亚共享的浅黄色多,似乎暗示并不存在南方途径入日本。少量的橘黄色也可能是同东北亚人群一起汇入的。与与美拉尼西亚共享的浅黄色我认为是日本旧石器土著的遗留。浅灰色西伯利亚和深蓝北极因素可能是通过萨哈林注入的,可能是新石器时代之后,但也可能是在中石器时代的细石器文化扩张的年代。
 楼主| 发表于 2010-12-20 17:08 | 显示全部楼层
2# Yungsiyebu
其实巴布亚成分在拉祜族、彝族、柬埔寨人中也有微量存在,这是比美拉尼西亚成分更纯粹的赤道人种成分。不过巴布亚成分和美拉尼西亚成分加起来也比不上印度成分对大东亚人群的影响。这在以前是我们所没有想到的。
 楼主| 发表于 2010-12-20 17:21 | 显示全部楼层
4# Yungsiyebu
对日本人的分析我也是这么想的。
 楼主| 发表于 2010-12-21 20:51 | 显示全部楼层
美拉尼西亚成分是在k=15 时才出现的,K=14时图片是这样的:
旋转 ADMIXTURE_14-1.png
从k=14到的变化,我们可以看出美拉尼西亚成分是由巴布亚成分为主,融合部分南亚蒙古利亚成分形成的。
 楼主| 发表于 2010-12-21 21:47 | 显示全部楼层
灰色成分在nganassan和yakut人中最高,在很多常染图中,yakut和nganassan人是可以分开的。我们可以认为这是K值还不够大的结果。对比下面环太平洋人群的常染图:

太平洋周边旋转1.jpg


对于北亚人群来说,dienekes的k=15时的情况相当于这张图K=9时的情况,yakut和nganassan还没有分开,而北极人种已经分为东西两部分。在k=10时,这张图已经把nganassan人和yakut分开了。nganassan人呈现出更深的黄色,同时以这种深黄色为主的还有ket,selkup人俄罗斯族中的黄色也是以这种深黄为主。虽然没有nganassan人体质学上最明确的报道,但可以认为他们更接近乌拉尔人种。从深黄色的分布格局来看,可以认为这种深黄色就是乌拉尔人种中的蒙古利亚成分,而nganassan人就是没有和欧罗巴人混血前最原始的乌拉尔人。
而这张图K=10时的中黄色成分,我认为可以对应北亚成分,因为凡是这种成分占优势的民族,如外蒙古人,阿尔泰人,图瓦人,布里亚特人,雅库特人,鄂温克人,都是典型的北亚人种。
发表于 2010-12-21 22:44 | 显示全部楼层
nganassan shaman
Demnine last Nganassan Shaman-2.jpg
Demnine last Nganassan Shaman.jpg
 楼主| 发表于 2010-12-21 23:04 | 显示全部楼层
我们以前曾经认为雅库特人和汉族是基本没有基因交流的,但是在dienekes的图上,雅库特人也有不到20%的远东成分。事实上所有北亚人种的民族都有相当比例的远东成分,雅库特已经是最少的了。而汉族中也有微量的不到5%的北亚成分,这显示了北方草原民族进入中原的民族融合确实存在。考虑到这是常染而非Y染色体,Y染色体表现出来的北亚特征会更明显。
 楼主| 发表于 2010-12-22 00:38 | 显示全部楼层
现代北亚各族之所以看起来离东亚各族而不是其他各族更近,是因为北亚各族普遍含有相当比例的远东成分,并且已经没有了绝对纯粹的北亚民族,而北亚成分最近的乌拉尔成分也基本上和欧罗巴成分混合,形成了乌拉尔人种,唯一含有比较纯粹的乌拉尔成分的nganassan人人数又极少,只有800多人,没有得到足够的重视。所以,人们常用来比较的是北极人种,而北极人种各族又基本不含有远东成分,这样一来北亚各族最接近的当然就是东亚各族了。
 楼主| 发表于 2010-12-22 00:43 | 显示全部楼层
以前我们是把雅库特人作为和汉族冰盛期一别后就再无融合的标准,现在看来雅库特人也不行,而要用nganassan人或者koryak人作为标准。
 楼主| 发表于 2010-12-22 01:11 | 显示全部楼层
下面是K=3时东亚某些民族的截图:
旋转 ADMIXTURE_3-1.png
 楼主| 发表于 2010-12-22 01:14 | 显示全部楼层
这是K=4时的截图:
旋转 ADMIXTURE_4-1.png
 楼主| 发表于 2010-12-22 01:24 | 显示全部楼层
K=4时是美洲成分的出现,亚洲北部民族中此时也有少量出现。但这意味着什么,要根据后面才能看出来。绿色成分最高频当然在美洲出现,截图如下:
旋转 ADMIXTURE_4-2.png
其中surui族和karitiana族几乎是全部的美洲成分,他们在K=3时是这样的:
旋转 ADMIXTURE_3-2.png
由此可见美洲成分是以东亚成分为主,加上部分欧洲(中东)成分形成的,比例就像surui族和karitiana族显示的那样。
 楼主| 发表于 2010-12-22 01:36 | 显示全部楼层
K=5时是巴布亚成分的出现,结果如下截图:
旋转 ADMIXTURE_5-1.png
在K=4时巴布亚还是呈现出东亚成分为主,加上部分欧洲成分,还有微量的非洲成分。但是这绝不代表巴布亚成分是由这三种成分融合起来的。而是说巴布亚成分中,绝大部分和东亚相近,少量和欧洲相近,微量和非洲相近,和美洲相近的没有。
发表于 2010-12-22 03:59 | 显示全部楼层
K=5时是巴布亚成分的出现,结果如下截图:
24753
在K=4时巴布亚还是呈现出东亚成分为主,加上部分欧洲成分,还有微量的非洲成分。但是这绝不代表巴布亚成分是由这三种成分融合起来的。而是说巴布亚成分中,绝大部 ...
wolfgang 发表于 2010-12-22 01:36
看過的常染色體分析, 有些數據顯示東亞人群較接近美洲土著人群, 有些數據則顯示東亞人群較接近巴布亞人群, 很有趣的現象, 不過第一個現象似乎比較常見。
发表于 2010-12-22 10:52 | 显示全部楼层
体质人类学意义上的北亚人种,以外蒙古(mongol组)为典型的中亚细亚类型代表,反映在常染色体上,约半成与西伯利亚族群共享,另外半成与东亚族群共享,还有10-20%上下的西欧亚混合。

而中国历史上接触的绝大多数游牧族群应当更类似呼伦贝尔蒙古族(mongola组),与远东共享的因素占优势。而南匈奴应该没有多少西伯利亚因素。

从维吾尔09年的那篇论文来看,与远东共享的主要是藏羌的灰色因素,而与中日韩共享的红色因素很微弱。考虑到最初的西藏B可能采样不带有普遍性,目前西藏人群体质特征还是表现为圆颅阔面,接近北亚人群,因此,推测这些灰色成分更似北方细石器猎民的主成份。而红色成分可能是南方来的农民。
发表于 2010-12-22 10:56 | 显示全部楼层
人们一提胡汉,往往把中间的戎狄忽略;其实,谈北方细石器猎民也往往直接简单化的等同于西伯利亚细石器猎民。通常所说的包括内蒙、西北在内的华北细石器还是与西伯利亚细石器有一定差异的。
发表于 2010-12-22 10:57 | 显示全部楼层
dendrogram15.png
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