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楼主: Yungsiyebu

线粒体单倍体群A4

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发表于 2010-9-7 19:35 | 显示全部楼层
A4得出的结论和常染的结论是一致的。
 楼主| 发表于 2010-9-7 21:24 | 显示全部楼层
Phylogeographic Differentiation of Mitochondrial DNA in Han Chinese

新疆XJ8409、武汉WH6247、青岛QD8164:A4(223 290 319 362)
新疆汉XJ8446:A4(223 289 290 319 362)无匹配
新疆汉2XJ8430、武汉汉WH6243:A4(223 274 290 319 362),与Eygin gol匈奴#63共享274。
武汉WH6980:A4(223 290 319 294 362),与布里亚特、哈萨克样本共享294。
武汉WH6959:A4(126 223 290 319 362),与回族、四川藏族样本共享126。
青岛QD8148:A4(131 222A 223 290 319 362)131和222均无匹配。
辽宁LN7604:A4(037 086 223 290 319 356 362)037无匹配,086与(新疆和呼和浩特)蒙古、西藏、Todjins、哈默尼干共享。与雅库特新石器晚期Kerdugen共享356。
云南YN178:A4(086 223 290 319 362),086与(新疆和呼和浩特)蒙古、西藏、Todjins、哈默尼干共享。
 楼主| 发表于 2010-9-7 23:19 | 显示全部楼层
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2010-9-7 23:32 编辑

Tracing the origins of Hakka and Chaoshanese by mitochondrial DNA analysis

客家-潮汕0092:A4(157 223 264 290 319 362)与韩国Kor83共享157,264无匹配。
客家-潮汕0092:A4(223 290 319 362)

广州样本A4比例很低,但发现了与韩国的匹配类型A4-16157,要么暗示东北亚沿海人群的南下,要么东南亚沿海人群北上对东北亚沿海地区的影响。因为这里考察的是据说北方起源的客家一系,所以自东北亚南下的可能性更大,且22楼文献,东南沿海人群无A4发现。

Analysis of mitochondrial DNA polymorphisms in Guangdong Han Chinese

广东#15:A4(209 223 290 294 319 362),209暂无匹配样本,而与布里亚特、哈萨克及武汉汉样本共享294。
广东#38:A4(223 290 319 362)
 楼主| 发表于 2010-9-8 00:10 | 显示全部楼层
Mitochondrial DNA Sequence Variation and Phylogenetic Analysis in Japanese Individuals from Miyazaki Prefecture,2007

日本Miyazaki70、71、72、73共4例A4(223 290 319 362),无特异性突变。
发表于 2010-9-8 02:47 | 显示全部楼层
根據Kivisild的老文獻<The Emerging Limbs and Twigs of the East Asian mtDNA Tree>, A4在西伯利亞東北角的楚科奇人群的確很高頻。

http://mbe.oxfordjournals.org/content/19/10/1737.full

 楼主| 发表于 2010-9-8 08:37 | 显示全部楼层
楚科奇的应当是A2,我这里分析的都是A4(XA2)。这篇文献中有广东一例A4,匹配情况如下:

The Emerging Limbs and Twigs of the East Asian mtDNA Tree

A4(222 223 249 290 319 362),与韩国#589、青岛QD8148共享222;与漠南鲜卑东大井98SD17、布里亚特Br552、阿尔泰Alt163、布里亚特Br627、Br390、Vn65、MT#ON125、乌兹别克Uzb5、KAR031共享249
 楼主| 发表于 2010-9-8 08:58 | 显示全部楼层
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2010-9-8 09:23 编辑

奇怪了,我怎么就没见这篇文献中有编码区数据呢?

The Peopling of Korea Revealed by Analyses of Mitochondrial DNA and Y-Chromosomal Markers

满族(n=40):没写采样地,但从文中的图看采样点可能在辽宁或吉林。
其中有1个A4、显示满族与古东北亚人种和现代韩国人的密切联系。

蒙古乌兰巴托人(n=47):2个A4,完全是大陆常见类型。

中国朝鲜族(n=51):没写采样地,从文中的图看采样点可能在辽宁或吉林。
其中有2个A4原型,2个A4*(其中1个带16256突变,见于湘西苗族),

北京汉族(n=40):1个A4原型

文中还有越南人的珍贵数据:1个A4-16185(特征突变与1个韩国样本相同)


http://konglong.5d6d.com/viewthr ... p;extra=&page=1


朝鲜的A4-16256,在我目前收集的A4样本中无匹配。

越南A4-16185与另一篇文献的韩国#588匹配。

蒙古方面有文献显示A4发生频度高达13%,但非常遗憾的是,我收集的文献没有一篇有编码区的。:L

满族方面也是如此,未见数据。
发表于 2010-9-8 10:13 | 显示全部楼层
楚科奇人群的A的確多是A2, 以下這篇文獻認為A2a是倒流回到西伯利亞的。

Beringian Standstill and Spread of Native American Founders

全文: http://www.plosone.org/article/i ... ournal.pone.0000829
附圖1: http://www.plosone.org/article/s ... l.pone.0000829.g001
附圖2: http://www.plosone.org/article/s ... l.pone.0000829.g002
 楼主| 发表于 2010-9-8 10:24 | 显示全部楼层
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2010-9-8 10:26 编辑

不分型的文献看着好累,不过,没白忙,确实找出一例A4:

中国内蒙古鄂伦春族线粒体DNA 高变区Ⅰ和高变区Ⅱ 遗传多态性

鄂伦春#19 A4(093 223 290 319 362),匹配样本:小河沿文化哈啦海沟S4、西藏N_Tib2868、回Hui113、鄂温克Ewk42、青海玉树藏族#39、哈萨克Kaz135、韩国#584、#585。
 楼主| 发表于 2010-9-8 10:34 | 显示全部楼层
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2010-9-8 10:48 编辑
楚科奇人群的A的確多是A2, 以下這篇文獻認為A2a是倒流回到西伯利亞的。

Beringian Standstill and Spread of Native American Founders

全文: http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal ...
natsuya 发表于 2010-9-8 10:13


我还没看西伯利亚东北族群的A4是不是也有一定A4(XA2),台湾小伙帮忙找一下文献。

A2实在A4(223 290 319 362)常见类型基础上多一步16111突变,美洲A2共祖年代1.39万年。

这篇文献中的亚洲数据是:

爱斯基摩全部都是A2
楚科奇的59例中有55例是A2,其中4例不是,但可惜对比人群没有编码区数据,不知道具体什么支系。

Population        N        Hg A        A2*
Eskimos        51        41        41
Chuckchi        155        59        55
Selkups        120        9        2
Kets        66        4       
Tundra Nenets        70        1       
Tuvas        202        8       
Tuva Kizal        73        1       
Khakas        185        7       
Altai        208        3       
Altai        131        5       
Shors        170               
Koryaks        71               
Nanais        85        3       
Uyghur        122        2       
Kazakhs        406        18       
Gilyaks (Nivkh)        58               
Oroks        61               
Kirghiz        105        11       
Uzbeks        48               
Tajiki        38        1       
Buriats        201        9       
Evenks (Chita)        94        9        2
Evenks (Sakha)        125        5       
Evenks (West-Central)        105        17       
Evens        105               
Yukaghirs        22               
Yakuts        423        8       
Dolgans (Sakha)        27        2       
Dolgans (Taymyr)        130        5       
Nganasans        107        5       
Total        3764


至于回流说法,我觉得不可信,可以看A2的系统树,亚洲的A2并非下游,反而北美阿帕奇Apche514一例处于亚洲的支系下,即A2a(192 233 331 362)。且1.39万的这个共祖年代应当恰好与迁徙美洲年代相当。
A2美洲亚洲.jpg
 楼主| 发表于 2010-9-8 12:01 | 显示全部楼层
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2010-9-8 12:06 编辑

Mitochondrial DNA diversity and population differentiation in southern East Asia

Dai-lu DA02: A4(223 274 290 319 362),与匈奴egyin gol#63、西藏、哈萨克、图瓦、新疆、哈默尼干等族样本共享274。
Dai-lu DA06: A4(124 223 290 319 362),与吉尔吉斯Kyr165共享124。
Danga-DA56、Mulam-ML26、DornQdayc-MQ203: A4(223 290 319 362)
DG27、Then-TN25:A4(126 223 290 319 362),与武汉WH6959样本共享126
Dong DN05:A4(093 223 290 319 362),与小河沿文化哈啦海沟S4、西藏N_Tib2868、回Hui113、鄂温克Ewk42、鄂伦春#19、青海玉树藏族#39、哈萨克Kaz135、韩国#584、#585共享093。
Dong DN08:A4(114 223 290 294 319 362),与红山文化的牛河梁N10共享114,同时与与布里亚特、哈萨克及武汉汉、广州汉样本共享294。
Dong DN10:A4(114 223 234 290 294 319 362),与红山文化的牛河梁N10共享114,与四川Garze藏人827、韩国#590共享234;同时与与布里亚特、哈萨克及武汉汉、广州汉样本共享294。
Lingao LG19:A4(104 111 223 362),319和290缺失;七郎山鲜卑、巴尔虎蒙古、韩国样本共享104;与Mollao-MO30共享111。
Lolo LL1:A4(223 294 362),319和290缺失;同时与与布里亚特、哈萨克及武汉汉、广州汉、侗族样本共享294。
Mollao-MO30:A4(093 104 111 235 362)223 290 319缺失,与小河沿文化哈啦海沟S4、西藏N_Tib2868、回Hui113、鄂温克Ewk42、鄂伦春#19、青海玉树藏族#39、哈萨克Kaz135、韩国#584、#585共享093;七郎山鲜卑、巴尔虎蒙古、韩国样本共享104;Lingao LG19共享111;与通海蒙古、回、吉尔吉斯共享235。
Pou-PO24:A4(147 223 290 319 362)无匹配。
Palyu-PY23:A4(129 223 290 319 362),与云南通海蒙古、呼和浩特蒙古共享129。
Then-TN04:A4(223 290 311 319 362),与秦劳工、西藏、韩国、吉尔吉斯、哈萨克、维吾尔、通海蒙古、正蓝旗蒙古、韩国、Fer068、哈默尼干等样本共享311。


牛河梁的A4-16114在侗族中找到,颇为意外,南方族群的大多数A4都与北方共享,频度非常低,似乎暗示北方族群的基因渗入。侗族A4-16114样本同时还携有与其他北方族群共享的突变,因此,更似北方族群的渗入,但A4-16114在目前北方族群的采样中依然缺失,很不寻常,当然牛河梁新石器的确年代太过久远了。
 楼主| 发表于 2010-9-8 12:35 | 显示全部楼层
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2010-9-8 12:37 编辑

Comparative analysis of mitochondrial DNA of Yakuts and other Asian populations, 2005

雅库特1例:A4(093 189 223 290 319 356 362),与与小河沿文化哈啦海沟S4、西藏N_Tib2868、回Hui113、鄂温克Ewk42、鄂伦春#19、青海玉树藏族#39、哈萨克Kaz135、韩国#584、#585侗Dong DN05共享093;与匈奴egyin gol、布里亚特Br442、鄂温克Evk42号、ES#Man(应为东西伯利亚Mansi)、布里亚特Br568号、鄂伦春Oro13、青海玉树藏族176、119、乌拉尔地区U-Udmurts、K-Komi(Zyryans)、P-Komi(Permyaks)、中亚Fer068、Kar070、哈萨克、吉尔吉斯、土库曼共享189;与雅库特新石器晚期的Kerdugen、鄂伦春、鄂温克若干样本、ES#Man(应为东西伯利亚Mansi)、蒙古(新疆)Mg30、正蓝旗蒙古2样本、中亚Kar070、哈萨克、吉尔吉斯、辽宁1例共享356。

雅库特样本就发现2例A,A4很明显继承了新石器晚期的Kerdugen文化人群血脉。
发表于 2010-9-8 21:23 | 显示全部楼层
分析太业余了,连高突变率的位点也算共享位点。
 楼主| 发表于 2010-9-8 21:58 | 显示全部楼层
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2010-9-8 22:40 编辑

本来就是票友,不必强调,这个东西我很清楚,类似STR,只是推测而已,高变区也不意味着一定就是偶然巧合,而即使不是高变区也不见得不能偶然巧合,事情不要走两个极端。而另一方面,也说明任何一种手段探究问题真像也都是有其局限性的,因此要综合分析。

此贴只是假设共享突变不是巧合,对错有赖于其他证据的附加综合讨论,但还没到这一步。我先把东西收集完,整体来看规律性还是非常清晰。
发表于 2010-9-9 10:26 | 显示全部楼层
A4的年龄约2.5万年,应与父系C3*相关密切,大约2万年前迁徙到东北,后来大规模扩张于东北。
发表于 2010-9-9 10:46 | 显示全部楼层
台湾原住民及海南琼海黎族都没有A4,连整个A类都没有,似乎说明早期的A并不是诞生及分布于南方沿海。但很明显,父系的C3*应是沿东海岸迁徙东北的,早期父系C3*与母系A(A4)又是如何接合的呢?很令人费解?
发表于 2010-9-9 11:09 | 显示全部楼层
从baiyueren版主以前的帖及图件来看,说A大致诞生于桂东北,高频区大致在湖南西部及湖北西部一带,因东部海岛原住民没看到有A类,因此,说诞生地及早期扩张地在内陆是很有可能的,但早期大约2.5万年前,在父系C3*沿海岸迁徙北方过程又是如何接合的呢?A到底诞生于父系的O系人群还是C3*人群?
 楼主| 发表于 2010-9-9 14:44 | 显示全部楼层
本帖最后由 Yungsiyebu 于 2010-9-9 14:46 编辑

从楚科齐人的情况来看,A早于其他如C、D等单倍体群的扩张,而美洲的A2(A4亚型)暗示A4至少在1万余年前已经远及西伯利亚东北。因此,推测A4应当与古西伯利亚(古亚细亚)人群相关联,他们相对纯粹的后裔如楚科齐、爱斯基摩等还是一高频出现的A2为特征。

目前我只找到了武汉等汉组的数据,其他南方汉族人群大多缺失A,武汉A4也未见明显的多样化,反而大多与北方人群共享,当然,如版主所说,这种共享可能是高变区偶然的巧合。
发表于 2010-9-9 15:26 | 显示全部楼层
本帖最后由 隆攀gdzq 于 2010-9-9 15:41 编辑

对早期母系A(A4)类与父系C3*、D相互关系推测:

据baiyueren《东亚人群线粒体N系单倍群的迁徙分化》里面关于A的内容,A及A4都诞生于桂东北,然后大概分三个方向迁徙扩张,往东至沿海地区、往北经湖南入湖北(后再往河南、西北等地)、往西走贵州云南方向。其中往东一支相对应的父系主要是O1a,也混有O3*,他们大概在3-2.5万年前已经活动于东部沿海一带,在东部沿海,他们碰到了父系的C3*人群,于是发生了你死我活的战争,其中O1a、O3的女人A(A4)等被C3*掳走并沿海岸迁徙东北,而O1a、O3也截获了C3*的女人M7类,但作为父系O系人群,盛冰期结束前,他们始终被限制在长江以南,甚至只能活动于岭南一带;向北方向,父系O3及母系A(A4)在湖南一带首先碰到了从云南沿长江而下的父系D人群,两个族群也发生了你死我活的战争,又一部分O3的女人A(A4)等被D掳走并迁徙日本。

发生年代大概在2.5万年前。
11.jpg
22.jpg
 楼主| 发表于 2010-9-9 16:04 | 显示全部楼层
对早期母系A(A4)类与父系C3*、D相互关系推测:

据baiyueren《东亚人群线粒体N系单倍群的迁徙分化》里面关于A的内容,A及A4都诞生于桂东北,然后大概分三个方向迁徙扩张,往东至沿海地区、往北经湖南入湖北(后再 ...
隆攀gdzq 发表于 2010-9-9 15:26


又见抢女人。呵呵,很亲切。
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